Amino asitler nasıl bir araya geliyor, 3 boyutlu yapı nasıl oluşuyor? Protein yapılarını çözmek, incelemek ve karmaşık protein etkileşimlerini anlamak için hangi teknikleri kullanıyoruz? Etkinlikte bu sorulara cevap ararken, teorik ve pratik oturumlar aracılığıyla protein yapılarını ve etkileşimlerini inceleyeceğiz. Pratik derslerle veritabanı kullanımı (NCBI BLAST, Expasy), protein görselleştirme (PDB, Chimera X), yapı modelleme (AlphaFold), protein etkileşimleri (PISA) ve moleküler kenetleme (HADDOCK, SWISSDOCK, FlexPepDock) konularını işleyeceğiz.
Ek Bilgi
Katılımcıların yanlarında laptop getirmesi ve etkinlik öncesinde aşağıdaki programları bilgisayarlarına yüklemeleri önerilir.
1- Chimera X : www.cgl.ucsf.edu/chimerax/
2- Pymol : www.pymol.org/edu/
Web sayfaları
1- PDB : www.rcsb.org/
2- NCBI : www.ncbi.nlm.nih.gov/
3- Expasy : www.expasy.org
4- BLAST : www.blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
5- AlphaFold : www.alphafold.ebi.ac.uk/
6- HADDOCK : (hesap oluşturunuz) www.wenmr.science.uu.nl/