Bu atölye, biyolojide tek hücre ve uzamsal ölçeklerdeki yaşamın derinlemesine anlaşılmasını sağlamak için tasarlanmıştır. Katılımcılar, merkezi dogma, veri işleme, entegrasyon, hücre tipi isimlendirilmesi, gen düzenleyici ağlar ve hücreler arası iletişim gibi temel konuları keşfedecekler. Ayrıca, uzamsal transkriptomik ve uzamsal veri analizi gibi ileri düzey yöntemlere giriş yapılacak. Çalıştay, teorik bilgilerin yanı sıra pratik uygulamalara da odaklanarak, Conda ortamı kurulumu ve AnnData formatıyla çalışma gibi teknik becerilerin geliştirilmesine imkan tanıyacaktır. Kurs projeleri aracılığıyla, ekip çalışması ve hipotez geliştirme becerileri desteklenecek ve gerçek biyolojik problemlere çözümler üretilecektir.
Event Details
Herkes
Bilimler Köyü
11 August 2025
10 August 2025
11 August 2025
—
17 August 2025
15 people
9000 TL
The participation fee covers tent accommodation within the Village campus, use of all common areas, three meals and one snack. Tea, water, and coffee are included. Our coordinators organize the events on a voluntary basis.
Event Purpose
Additional Info
Temel biyoloji bilgisi, istatistiki kavramlara aşinalık, İngilizce, taşınabilir bilgisayar
Schedule
| Day | Content |
|---|---|
| Day 1 | Sabah// Farklı ölçeklerde hayat// Biyolojide bilgi akışı: santral dogma// // Öğleden Sonra// Conda ortamının kurulumu ve Python araçları// Visual Studio Code ve Jupiter not defterleri// AnnData formatına giriş |
| Day 2 | Sabah// Örnek olay çalışması: Meme kanserinde Epitel-Mezenkimal geçiş// Kurs projesi: Takımların oluşturulması ve hipotezlerin belirlenmesi// // Öğleden Sonra// Veri ön işleme// Entegrasyon ve parti (batch) düzeltme// Hücre tipi isimlendirmesi |
| Day 3 | Sabah// İçsel ve dışsal bilgilerin çıkarımı// Kopya numarası değişiklikleri// Gen düzenleyici ağlar// Hücreler arası iletişim// // Öğleden Sonra// Kopya numarası değişikliklerinin çıkarımı// Transkripsiyon faktörleri// Ligand-reseptör çiftleri// |
| Day 4 | TATİL |
| Day 5 | Sabah// İki boyutta hayat// Uzamsal transkriptomik// // Öğleden Sonra// Uzamsal veri işleme// Spot isimlendirilmesi// Komşulukların bulunması: SpottedPy// Uzamsal hücreler arası iletişim |
| Day 6 | Kurs projesi sunumları |
| Day 7 | Kapanış konuşması// Katılımcılardan geri bildirim// Köyden ayrılış |