Atomlardan Proteinlere : Yapısal Biyoloji Teknik ve Uygulamaları
Event Details
- Place Bilimler Köyü
- Registration Deadline April 30, 2026
- Arrival Date July 5, 2026
- Start Date July 6, 2026
- End Date July 12, 2026
- Quota 15 people
- Target Audience Lisans ve Lisansüstü Öğrencileri
- Event Fee 12.500 TL
Event Purpose
Amino asitler nasıl bir araya geliyor, 3 boyutlu yapı nasıl oluşuyor? Protein yapılarını çözmek, incelemek ve karmaşık protein etkileşimlerini anlamak için hangi teknikleri kullanıyoruz? Etkinlikte bu sorulara cevap ararken, teorik ve pratik oturumlar aracılığıyla protein yapılarını ve etkileşimlerini inceleyeceğiz. Pratik derslerle veritabanı kullanımı (NCBI BLAST, Expasy), protein görselleştirme (PDB, Chimera X), yapı modelleme (AlphaFold), protein etkileşimleri (PISA) ve moleküler kenetleme (HADDOCK, SWISSDOCK, FlexPepDock) konularını işleyeceğiz.
Ek Bilgi
Katılımcıların yanlarında laptop getirmesi ve etkinlik öncesinde aşağıdaki programları bilgisayarlarına yüklemeleri önerilir.
1- Chimera X : www.cgl.ucsf.edu/chimerax/
2- Pymol : www.pymol.org/edu/
Web sayfaları
1- PDB : www.rcsb.org/
2- NCBI : www.ncbi.nlm.nih.gov/
3- Expasy : www.expasy.org
4- BLAST : www.blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
5- AlphaFold : www.alphafold.ebi.ac.uk/
6- HADDOCK : (hesap oluşturunuz) www.wenmr.science.uu.nl/
Additional Info
Üniversitelerin Doğa Bilimleri, Fen ve Mühendislik Fakültelerinde Lisans ya da Lisansüstü öğrencilerine yöneliktir.
Schedule
| Day | Content |
|---|---|
| Day 1 |
Teorik dersler: Atomların mimarisi: Protein yapısı Pratik dersler: Veritabanları kullanımı; NCBI BLAST, Expasy |
| Day 2 |
Teorik dersler: Atomları görmek: Yapısal Biyoloji teknikleri I Pratik dersler: PDB ve Chimera X kullanımı |
| Day 3 |
Teorik dersler Atomları görmek: Yapısal Biyoloji teknikleri II Pratik dersler: Protein yapı modelleme AlphaFold |
| Day 4 |
TATİL |
| Day 5 |
Teorik dersler Protein etkileşimleri, kenetleme (docking) Pratik dersler: Etkileşim yüzeyleri (PISA), Moleküler kenetleme (SwissDock, FlexPepDock) |
| Day 6 |
Teorik dersler: Haftanın Özeti ve Sunum hazırlama Pratik dersler: Öğrenci sunumları |
| Day 7 |
Kariyer söyleşisi: Kariyer yolculuğumuz ve soru- cevap |