ATCG sanatı:

Genetik data analizi ve görselleştirme

Yürütücüler
Cenk Çelik

Amaç-İçerik
Bu atölye programı, öğrencilere temel R programlama becerilerini kazandırmakla birlikte, genetik veri analizi, biyoinformatik veri madenciliği ve makine öğrenimi uygulamalarına dair pratik bilgiler sunmayı amaçlamaktadır. Uygulamalı projeler ve çalışma zamanları, öğrenilen bilgilerin derinleştirilmesine ve projelerin gerçek dünya uygulamalarına dönüştürülmesine fırsat tanıyacaktır. Katılımcılar, bir biyoinformatik projesinin baştan sonra oluşturulma süreçlerini ve bulguların görselleştirilme yöntemlerini uygulamalı olarak öğrenecekler. Bu süreçte, hem tekrar edilebilir analizler için versiyon kontrolü gibi püf noktaları öğrenmenin yanı sıra, kanser hastalarından elde edilen verileri kullanarak, gen ekspresyonu analizi, mutasyon profili, DNA metilasyonu ve kopya sayısı değişimleri gibi detaylı analizleri yapacaklardır.

Kontenjan
15

Kimlere?
Temel biyoloji bilgisi, başlangıç seviyesinde İngilizce gerekir. Bir de taşınabilir bilgisayar.

Ücret
Etkinlik katılımcıları çadırda kalır, yedi gün dört öğün yemek, temel ihtiyaçlar hepsi dahil 6.400 TL’dir.

Detaylı İçerik
Daha sonra açıklanacak

1. Gün
Biyoloji ve Temel İstatistik
– Biyolojik sistemlerde bilginin aktarımı
– Ortalama, ortanca, p değeri ve temel istatistiki testler

2. Gün
R Programlamaya Giriş
– R ve RStudio
– Temel veri yapıları
– Paketler
– Bioconductor topluluğu

3. Gün
Biyoinformatik Veri Analizi
– Biyolojik veri tipleri
– Örnek çalışma: Kanser Genom Atlası veri analizi
– Veri görselleştirme

4. Gün    TATİL

5. Gün
Makine Öğrenmesi ile Biyoinformatik
– Makine Öğrenmesi temelleri
– Biyoinformatikte MÖ ile hastalık tahmini
– Proje calışma zamanı

6. Gün
Proje Sunumları
– Katılımcı proje sunumları ve kodların değerlendirilmesi

7. Gün
Proje sunumları ve değerlendirmeye devam

Afişi Pdf olarak indirmek için tıklayınız

ATCG sanatı:

Genetik data analizi ve görselleştirme

Yürütücüler
Cenk Çelik

Amaç-İçerik
Bu atölye programı, öğrencilere temel R programlama becerilerini kazandırmakla birlikte, genetik veri analizi, biyoinformatik veri madenciliği ve makine öğrenimi uygulamalarına dair pratik bilgiler sunmayı amaçlamaktadır. Uygulamalı projeler ve çalışma zamanları, öğrenilen bilgilerin derinleştirilmesine ve projelerin gerçek dünya uygulamalarına dönüştürülmesine fırsat tanıyacaktır. Katılımcılar, bir biyoinformatik projesinin baştan sonra oluşturulma süreçlerini ve bulguların görselleştirilme yöntemlerini uygulamalı olarak öğrenecekler. Bu süreçte, hem tekrar edilebilir analizler için versiyon kontrolü gibi püf noktaları öğrenmenin yanı sıra, kanser hastalarından elde edilen verileri kullanarak, gen ekspresyonu analizi, mutasyon profili, DNA metilasyonu ve kopya sayısı değişimleri gibi detaylı analizleri yapacaklardır.

Kontenjan
15

Kimlere?
Temel biyoloji bilgisi, başlangıç seviyesinde İngilizce gerekir. Bir de taşınabilir bilgisayar.

Ücret
Etkinlik katılımcıları çadırda kalır, yedi gün dört öğün yemek, temel ihtiyaçlar hepsi dahil 6.400 TL’dir.

Detaylı İçerik
Daha sonra açıklanacak

1. Gün
Biyoloji ve Temel İstatistik
– Biyolojik sistemlerde bilginin aktarımı
– Ortalama, ortanca, p değeri ve temel istatistiki testler

2. Gün
R Programlamaya Giriş
– R ve RStudio
– Temel veri yapıları
– Paketler
– Bioconductor topluluğu

3. Gün
Biyoinformatik Veri Analizi
– Biyolojik veri tipleri
– Örnek çalışma: Kanser Genom Atlası veri analizi
– Veri görselleştirme

4. Gün    TATİL

5. Gün
Makine Öğrenmesi ile Biyoinformatik
– Makine Öğrenmesi temelleri
– Biyoinformatikte MÖ ile hastalık tahmini
– Proje calışma zamanı

6. Gün
Proje Sunumları
– Katılımcı proje sunumları ve kodların değerlendirilmesi

7. Gün
Proje sunumları ve değerlendirmeye devam

Afişi Pdf olarak indirmek için tıklayınız