Proteinler hakkında her şey

Protein yapısı ve mühendisliği

Yürütücüler
Burcu Kaplan Türköz, Bahar Bakar, Seyhan İçier

Amaç-İçerik
Santral dogma, protein yapısı, yapısal biyoloji teknikleri, protein mühendisliği

Kontenjan
15

Kimlere?
Doğa bilimleri, Fen ve Mühendislik fakülteleri lisans veya lisansüstü öğrencilerine.

Ücret
Etkinlik katılımcıları çadırda kalır, yedi gün dört öğün yemek, temel ihtiyaçlar hepsi dahil 6.400 TL’dir.

Ek Hazırlık
Etkinlik öncesi bilgisayarlarına aşağıdaki programları yüklemeleri önerilir.
Chimera X: https://www.cgl.ucsf.edu/chimerax/
APE: https://jorgensen.biology.utah.edu/wayned/ape/

Ayrıca aşağıdaki web sayfalarına bir göz atabilirler
PDB: https://www.rcsb.org/
NCBI: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Expasy: https://www.expasy.org
BLAST: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
AlphaFold: https://alphafold.ebi.ac.uk/
HADDOCK: https://wenmr.science.uu.nl/

Detaylı İçerik
1.Gün
Teorik oturum:
Hayatın sırrı: DNA’dan proteine
Uygulama oturumu:
Veritabanları kullanımı; NCBI BLAST, Expasy, ApE kullanımı

2.Gün
Teorik oturum:
Atomların mimarisi: Protein yapısı
Uygulama oturumu:
Protein üretimi ve saflaştırma video gösterim ve tartışma

3.Gün
Teorik oturum:
Atomları görmek: Yapısal Biyoloji teknikleri-I
Uygulama oturumu:
PDB ve Chimera X kullanımı

4.Gün    TATİL

5.Gün
Teorik oturum:
Atomları görmek: Yapısal Biyoloji teknikleri-II
Uygulama oturumu:
Protein yapı modelleme AlphaFold ve HADDOCK kullanımı

6.Gün
Teorik oturum:
Atomları değiştirmek: Protein mühendisliği teknikleri
Uygulama oturumu:
Protein yapı modelleme AlphaFold ve HADDOCK kullanımı

7.Gün
Seminerler ve Kariyer söyleşisi
1) Biz laboratuvarda neler yapıyoruz
2) Kariyer yolculuğumuz ve soru- cevap

Afişi Pdf olarak indirmek için tıklayınız

Proteinler hakkında her şey

Protein yapısı ve mühendisliği

Yürütücüler
Burcu Kaplan Türköz, Bahar Bakar, Seyhan İçier

Amaç-İçerik
Santral dogma, protein yapısı, yapısal biyoloji teknikleri, protein mühendisliği

Kontenjan
15

Kimlere?
Doğa bilimleri, Fen ve Mühendislik fakülteleri lisans veya lisansüstü öğrencilerine.

Ücret
Etkinlik katılımcıları çadırda kalır, yedi gün dört öğün yemek, temel ihtiyaçlar hepsi dahil 6.400 TL’dir.

Ek Hazırlık
Etkinlik öncesi bilgisayarlarına aşağıdaki programları yüklemeleri önerilir.
Chimera X: https://www.cgl.ucsf.edu/chimerax/
APE: https://jorgensen.biology.utah.edu/wayned/ape/

Ayrıca aşağıdaki web sayfalarına bir göz atabilirler
PDB: https://www.rcsb.org/
NCBI: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Expasy: https://www.expasy.org
BLAST: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
AlphaFold: https://alphafold.ebi.ac.uk/
HADDOCK: https://wenmr.science.uu.nl/

Detaylı İçerik
1.Gün
Teorik oturum:
Hayatın sırrı: DNA’dan proteine
Uygulama oturumu:
Veritabanları kullanımı; NCBI BLAST, Expasy, ApE kullanımı

2.Gün
Teorik oturum:
Atomların mimarisi: Protein yapısı
Uygulama oturumu:
Protein üretimi ve saflaştırma video gösterim ve tartışma

3.Gün
Teorik oturum:
Atomları görmek: Yapısal Biyoloji teknikleri-I
Uygulama oturumu:
PDB ve Chimera X kullanımı

4.Gün    TATİL

5.Gün
Teorik oturum:
Atomları görmek: Yapısal Biyoloji teknikleri-II
Uygulama oturumu:
Protein yapı modelleme AlphaFold ve HADDOCK kullanımı

6.Gün
Teorik oturum:
Atomları değiştirmek: Protein mühendisliği teknikleri
Uygulama oturumu:
Protein yapı modelleme AlphaFold ve HADDOCK kullanımı

7.Gün
Seminerler ve Kariyer söyleşisi
1) Biz laboratuvarda neler yapıyoruz
2) Kariyer yolculuğumuz ve soru- cevap

Afişi Pdf olarak indirmek için tıklayınız